闪电河湿地动植物资源十分丰富，有野生植物50科、140属、210种。其中蕨类植物有2科、2属、3种；被子植物有48科、138属、207种，其中双子叶植物39科、104属、160种，单子叶植物9科、34属、47种。植物区系属于欧亚草原植物亚区的蒙古草原地区，以植物、湿生植物和水生植物较为丰富。代表植物以草本植物为主，在大面积地势低平的洼地、草甸主要分布有白刺、碱蓬、中亚苔草、羊草等植物；周边陆地区域分布着以盐地碱蓬、灰绿藜、委陵菜、碱茅、狗尾草等植物，多为一年生草本植物；在河流、湖泊等水域分布有金鱼藻、杉叶藻、芦苇、狭叶香藩、水麦冬、泽泻等水生或沼生植物。

 有陆生脊椎动物222种，隶属于4纲26目59科138属。其中两栖纲1目3科3属5种，爬行纲1目4科7属11种，鸟纲17目40科105属176种，哺乳纲6目12科25属32种。在222种野生动物中，尤其以鸟类资源最为丰富，占公园总种数的79.3%，是湿地内陆生野生脊椎动物的主要类群。其中国家Ⅰ级重点保护动物4种，即黑鹳、大鸨，中华秋沙鸭 ，金雕 ，国家Ⅱ级重点保护动物27种，包括大天鹅、小天鹅、鹗、草原雕、乌雕、鸢、苍鹰、雀鹰、普通鵟、大鵟、白尾鹞、鹊鹞、红脚隼、燕隼、红隼、黄爪隼、红角鸮、纵纹腹小鸮、短耳鸮、长耳鸮、白枕鹤和灰鹤 、角鸊鷉、鸳鸯 、白额雁 、斑羚）以及石貂。